在2025赛季足协杯的第三轮比赛中，一场场激烈的角逐轮番上演。继武汉三镇和梅州客家在首轮比赛中遗憾出局后，深圳新鹏城和长春亚泰也在残酷的点球决战中败下阵来。然而，申花、海港、国安、蓉城、泰山以及大连英博则以大比分的优势战胜对手，成功晋级下一轮。

首个比赛日，浙江队凭借着坚定的防守和一次精妙的进攻，以1比0的比分战胜广州蒲公英，成功晋级下一轮。武汉三镇则遭遇了陕西联合的顽强抵抗，最终以1比2的比分落败，梅州客家也遭遇了同样的命运，以1比2不敌广西恒宸，两支中超球队连续两个赛季在足协杯中一轮游。

周三的比赛中，大连英博在客场以5比1的比分战胜深圳青年人，展现出强大的实力。青岛西海岸则在客场以2比0战胜延边龙鼎。而在上海申花的比赛中，他们在客场经过激烈的角逐后以2比0战胜无锡吴钩。另一场比赛中，云南玉昆在落后一球的情况下奋起直追，最后时刻连入两球，以2比1的比分逆袭定南赣联。

在广东广州豹与深圳新鹏城的比赛中，夏达龙在上半场头球梅开二度，为广州豹取得领先。然而新鹏城在比赛末段展开反击，萨卡里亚扳回一分。周大地小禁区将球推入空门，帮助新鹏城扳平比分。然而在点球决战中，姜至鹏罚丢点球，新鹏城最终遗憾出局。

辽宁铁人与青岛海牛的比赛则是一场实力接近的较量。青岛海牛在中超联赛中排名倒数第二位，而辽宁铁人在中甲联赛中表现出色。两队在90分钟内互交白卷，但在点球决战中，臧一锋和栗鹏的点球被扑出，青岛海牛最终以4比2的比分涉险过关。

大连鲲城与长春亚泰的比赛中，朱世玉打入世界波为大连鲲城首开纪录。谭龙为长春亚泰扳平比分。两队在90分钟内战成1比1平手。在随后的点球决战中，罗西奇、雷文杰和谭龙均罚丢点球，大连鲲城最终以3比2的比分晋级16强。

其他几场比赛中，青岛红狮轻松战胜山东泰山，苏州东吴与上海海港的比赛则是一场进球大战。最终海港以6比2的比分大胜对手晋级。重庆铜梁龙与河南队的比赛也十分激烈，最终河南队以2比1的比分胜出。石家庄功夫则以5比0的大比分战胜北京国安晋级。广西平果主场对阵成都蓉城的比赛同样精彩纷呈，成都蓉城以3比0的比分取得胜利。贵州筑城竞技以1比0的比分小胜天津津门虎晋级下一轮。

最终在第三轮比赛中，浙江队、大连英博、青岛西海岸、上海申花、云南玉昆、河南队、北京国安、山东泰山、上海海港、成都蓉城、天津津门虎以及青岛海牛等12支中超球队顺利晋级下一轮比赛。而武汉三镇、梅州客家、深圳新鹏城以及长春亚泰等4支中超球队则遗憾出局。此外陕西联合、广州豹以及大连鲲城三支中甲球队晋级16强，而广西恒宸则成为唯一一支晋级的中乙球队。